Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
APOFQ13790 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
APOFQ13790 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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APOFQ13790 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
APOFQ13790 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
APOFQ13790 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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