Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LAMB3Q13751 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms