Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUL4BQ13620 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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