Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ATRQ13535 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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