Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIM28Q13263 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIM28Q13263 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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