Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CALCOCO2Q13137 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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