Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DUSP4Q13115 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms