Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CHAF1BQ13112 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CHAF1BQ13112 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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