Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC10A2Q12908 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC10A2Q12908 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms