Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCB1Q12824 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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