Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFEMP1Q12805 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFEMP1Q12805 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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