Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TWF1Q12792 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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