Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPN11Q06124 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms