Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDR2Q01850 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms