Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MS4A2Q01362 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MS4A2Q01362 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MS4A2Q01362 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms