Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK16Q00536 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms