Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAP25P60880 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms