Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVFC1P60507 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms