Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DCDC1P59894 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms