Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LOXL3P58215 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms