Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NUP107P57740 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms