Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NME5P56597 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NME5P56597 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NME5P56597 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms