Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL23P55773 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL23P55773 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL23P55773 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL23P55773 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL23P55773 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL23P55773 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL23P55773 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL23P55773 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL23P55773 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL23P55773 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL23P55773 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL23P55773 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL23P55773 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL23P55773 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms