Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CASP9P55211 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CASP9P55211 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CASP9P55211 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms