Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CRIP1P50238 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms