Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRT6CP48668 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms