Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ME1P48163 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ME1P48163 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ME1P48163 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ME1P48163 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ME1P48163 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms