Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RANGAP1P46060 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RANGAP1P46060 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms