Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A1P43005 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms