Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTNNB1P35222 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms