Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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CASQ1P31415 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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CASQ1P31415 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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CASQ1P31415 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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