Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CNGA1P29973 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNGA1P29973 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms