Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GJB2P29033 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB2P29033 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB2P29033 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms