Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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MSX1P28360 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSX1P28360 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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