Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCNA2P20248 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms