Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCL3P19876 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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