Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATF3P18847 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATF3P18847 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATF3P18847 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATF3P18847 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATF3P18847 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATF3P18847 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATF3P18847 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms