Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.3 ms