Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
E2F6O75461 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms