Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PPFIA3O75145 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms