Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXO3O43524 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms