Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRTO14522 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms