Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms