Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XIRP2A4UGR9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XIRP2A4UGR9 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms