Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PIPSLA2A3N6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms