Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVW-1Q9UQF0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms