Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK1Q9UPV9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms