Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STAG3Q9UJ98 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms