Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH3Q9UHC1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms