Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CGGBP1Q9UFW8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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